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神经外科成立于上世纪八十年代初期，扬州市临床重点专科。科室共有主任医师5人，副主任医师8人，主治医师3人，住院医师2人，专科科研员1人。硕士研究生导师3人，博士学位5人。江苏省神经外科学会委员1人，扬州市神经外科专业委员会副主任委员1人。
科室拥有美敦力神经导航，Leica显微镜，Storz神经内镜， CUSA等多种仪器。现有床位西区35张，东区25张。科室常规开展复杂颅内动脉瘤显微手术夹闭，颅内外血管搭桥手术（低流量），复杂AVM切除手术，颈内动脉内膜剥脱术，功能区和深部肿瘤保全功能病灶切除，神经内镜下鞍区病变切除手术，内镜下各部位脑出血清除术，内镜下三脑室造瘘手术，脑室肿瘤切除手术，保全面神经功能听神经瘤切除手术，复杂乙状窦脑膜瘤手术，微血管减压手术，DBS，颅底肿瘤切除手术，椎管内肿瘤切除手术，立体定向引导穿刺引流或活检手术，脑外伤及脑出血手术治疗，全脑血管及脊髓造影术，动脉瘤及血管畸形介入栓塞，动静脉瘘介入栓塞等。专科特色以脑血管病的外科治疗为主。年出院患者1300人，年手术量500台。
科室主持江苏省科技厅项目1项，扬州市课题1项，扬州大学孵化项目1项，参研国家自然科学课题2项。发表SCI论文20余篇，中华系列论文数十篇。多次荣获扬州市卫健委新技术引进奖一、二等奖，申请发明专利数十项，并多次举办省、市级学术会议。
