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扬州大学附属医院儿科成立于1960年，为江苏省临床重点专科建设单位，是扬州市医学会儿科专业委员会主任委员单位，扬州市儿科临床质量控制中心挂靠单位。是集医疗、教学和科研为一体的临床专科。
本专业年收治住院患儿6000人次左右；年门急诊量34万人次以上。拥有3个病区（2个普儿内科，1个含NICU的新生儿病区），床位144张。现有医护人员109名，其中博士研究生4名，硕士研究生22名，硕士研究生导师3名，高级专业技术职称医师13名、高级专业技术职称护师11名；护士本科学历占比达50%以上。本科室有美国医学会儿科学分会中国教育基地讲师2名，江苏省高层次创新创业人才2名，儿科科护士长为“全国三八红旗手”、全国卫生系统道德建设标兵、“江苏最美巾帼人物”。
本专科常规开展儿童及新生儿常见疾病诊疗工作，能迅速有效地处理休克、重度脱水、心力衰竭、呼吸衰竭、肾炎、肾病、急慢性肾功能不全、癫痫持续状态、糖尿病酮症酸中毒、严重心律失常等各种疑难杂症和危重病例。
科室一直重视亚专科建设，目前已有新生儿、儿童呼吸、内分泌、神经亚专业。目前建成新生儿重症监护中心（NICU）、儿童雾化治疗中心、儿童脱敏治疗中心、小儿肺功能室。2003年起开展本市及周边地区危重儿的转运。2010年起，对儿童性早熟、矮小症、甲状腺功能亢进、尿崩症、糖尿病等进行系统诊断和治疗，长期随访。2014年起开展儿童纤维支气管镜的诊疗技术，应用于儿童慢性咳嗽病因诊断以及进行肺泡灌洗治疗重症难治性肺炎。2017年起应用脑功能监测仪诊断新生儿脑损伤、癫痫等疾病以及治疗预后的判断。
近3年在省级以上专业杂志发表论文140余篇，9项国家级、省市级科研课题在研。获省卫生厅新技术引进二等奖一项、市级科技进步奖7项、省科技进步三等奖（第三完成人）1项。作为扬州大学附属医院，参与扬州大学医学院本科班临床教学；每年培养研究生数名，并担负外国留学生临床带教工作。作为国家级住院医师规范化培训教学基地，负责儿科住院医师规范化培训，同时担负扬州大学、东南大学医学院、南京医科大学等多所医学院同学的实习带教工作。每年通过继续教育项目，面向基层医院开展技术培训及学术讲座。每年接受各级医院进修医生数名。重视在职人员培训、继续深造。
